PROFIL SEKUEN GEN MATK, rbcL, dan trnL MORACEAE

Bilah Samping Artikel

PDF (English)
Terbitan
Vol 35 (2023): Seminar Nasional Biologi (SEMABIO) Tahun 2023
Diterbitkan: Dec 12, 2023

Isi Artikel Utama

Apta Adi Wahyu
Universitas Nusantara PGRI Kediri
Seagames Waluyo
PT. Sciencewerke
Agus Muji Santoso
Universitas Nusantara PGRI Kediri

Abstrak

Penanda molekuler menjadi salah satu kajian strategis dalam pemuliaan dan konsenvasi tanaman. Kelompok tanaman Moraceae memiliki potensi yang cukup luas dalam bidang sumber pangan, obat, hias, dan ekologi. Ketersediaan data base sekuen materi genetik juga menjadi salah satu pertimbangan dalam menunjang keberhasilan eksplorasi penanda molekuler tanaman Moraceae. Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan profil sekuen gen MatK, rbcL, dan trnL kelompok Moraceae. Penelitian ini dilakukan dengan mengunduh informasi sekuen gen melalui laman NCBI. Data berupa nama ilmiah tanaman, identitas gen, panjang sekuen, dan lokus gen ditabulasi dan dianalisis secara deskriptif. Penelitian ini mengungkapkan bahwa terdapat 30 data base sekuen gen MatK, rbcL, dan trnL secara berurutan memiliki panjang bervariasi yaitu 1428 bp, 1518 bp, dan 81 bp.

Unduhan

Data unduhan belum tersedia.

Rincian Artikel

Bagian
Articles
Creative Commons License

Artikel ini berlisensi Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Biografi Penulis

Apta Adi Wahyu, Universitas Nusantara PGRI Kediri

Prodi Pendidikan Biologi

Seagames Waluyo, PT. Sciencewerke

Application Scientist

Agus Muji Santoso, Universitas Nusantara PGRI Kediri

Kelompok Studi Biodiversitas

Referensi

in, S. S., & Sufian, M. (2023). DNA Barcode for Phylogenetic Analysis of Genus Morus Species from Azad Jamu and Kashmir. 55(6), 2211–2220.

Azrai, M. (2005). Pemanfaatan markah molekuler dalam proses seleksi pemuliaan tanaman. Jurnal AgroBiogen, 1(1), 26–37.

Barthet, M. M., & Hilu, K. W. (2007). Expression of matK: Functional and evolutionary implications. American Journal of Botany, 94(8), 1402–1412. https://doi.org/10.3732/ajb.94.8.1402.

Collard, B. C. Y., Jahufer, Z., Chi, E., & Pang, K. (2005). An introduction to markers , quantitative trait loci ( QTL ) mapping and marker-assisted selection for crop improvement: The basic concepts An introduction to markers , quantitative trait loci (QTL) mapping and marker-assisted selection for crop improv. January. https://doi.org/10.1007/s10681-005-1681-5.

Hilu, K. W., & Barthet, M. M. (2008). Mode and tempo of matK: Gene evolution and phylogenetic implications. Evolutionary Biology from Concept to Application, 165–179. https://doi.org/10.1007/978-3-540-78993-2_10.

Nadeem, M. A., Nawaz, M. A., Qasim, M., Comertpay, G., Yildiz, M., Ahmad, F., Alsaleh, A., Labhane, N., Ozkan, H., Chung, G., Azhar, M., Shahid, Q., Dogan, Y., Comertpay, Hatipoglu, R., Baloch, F. S. (2018). DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing. 2818. https://doi.org/10.1080/13102818.2017.1400401.

Nurhasanah, Sundari, & Papuangan, N. (2019). Amplification and Analysis of Rbcl Gene (Ribulose-1,5-Bisphosphate Carboxylase) of Clove in Ternate Island. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science, 276(1), 0–7. https://doi.org/10.1088/1755-1315/276/1/012061.

Njurumana, G. N., Marsono, D., Ronggo Sadono, dan, Doktor Ilmu Kehutanan, P., Kehutanan UGM, F., Penelitian Kehutanan Kupang, B., & Untung Suropati No, J. (2014). Konservasi keanekaragaman hayati tanaman pada Sistem kaliwu di pulau sumba (Plant Biodiversity Conservation on Kaliwu System at Sumba Island). Maret, 21(1), 75–82.

Sulistyawati, P. (2017). Keragaman Genetik Populasi Kayu Merah (Pterocarpus indicus Willd) menggunakan penanda random amplified Polymorphism DNA Genetic diversity in Kayu merah (Pterocarpus indicus Willd) populations using random amplified polymorphism DNA marker. 11(1), 67–76.

Won, H., & Renner, S. S. (2005). The chloroplast trnT-trnF region in the seed plant lineage Gnetales. Journal of Molecular Evolution, 61(4), 425–436. https://doi.org/10.1007/s00239-004-0240-3.

Zeng, Q., Chen, M., Wang, S., Xu, X., Li, T., Xiang, Z., & He, N. (2022). Comparative and phylogenetic analyses of the chloroplast genome reveal the taxonomy of the Morus genus. Frontiers in Plant Science, 13(November), 1–12. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.1047592

Zivanovic, I., Vukovic, D., Dakic, I., Stefanovic, G., Savic, B., Zhao, Y. L. Y. Y., Li, G., Sun, C., Li, C., Wang, X. X., Liu, H., Zhang, P., Zhao, X., Wang, X. X., Jiang, Y., Yang, R., Wan, K., Zhou, L., Zhang, S.-L. S., … Ameni, G. (2012). Genotypic characterization of multi-drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Myanmar. Journal of Clinical Microbiology, 9(1), 1–9. http://openurl.ingenta.com/content/xref?genre=article&issn=1027-3719&volume=18&issue=8&spage=946%5Cnhttp://openurl.ingenta.com/content/xref?genre=article&issn=2220-8372&volume=3&issue=2&spage=160%5Cnhttp://jcm.asm.org/cgi/doi/10.1128/JCM.00691-07%5Cnhttp